Una gran cantidad de nuevos datos de secuencia genómica llena un vacío importante en el árbol de la vida de la mosca de la fruta, informan Bernard Kim, de la Universidad de Stanford en EE. UU., y sus colegas en la revista de acceso abierto. Más biologíaPublicación el 18 de julio.
Las moscas de la fruta son organismos modelo clásicos en la investigación biológica y fueron una de las primeras especies en las que se secuenció todo su genoma. Con más de 4.400 especies, la diversidad de la familia de las moscas de la fruta ofrece información sobre los patrones y procesos evolutivos. Pero sólo una fracción de estas especies tiene sus genomas secuenciados, y la mayoría de las secuencias genómicas de moscas de la fruta publicadas pertenecen a un número muy limitado de especies con cepas endogámicas representativas de laboratorio.
Para abordar esto, los investigadores secuenciaron los genomas de 179 especies de moscas de la familia Drosophila, incluidas moscas capturadas en la naturaleza, especímenes conservados en museos y cepas criadas en laboratorio.
Utilizando un enfoque de secuenciación híbrida que combina nuevas tecnologías de secuenciación de lectura corta y larga, pudieron generar secuencias genómicas de alta calidad y bajo costo a partir de material limitado.
Utilizaron las nuevas secuencias del genoma y los datos publicados anteriormente para producir un árbol filogenético para 360 especies de la familia Drosophila, revisando nuestra comprensión de las relaciones evolutivas de estas especies. Reunieron casi 300 genomas de moscas de la fruta como herramienta de código abierto para futuras investigaciones genómicas comparadas, como el ensamblaje del genoma completo.
Si bien los esfuerzos de secuenciación a gran escala de organismos grandes como los mamíferos están en marcha, este estudio muestra que ahora es posible secuenciar el genoma de organismos pequeños como moscas individuales, que se han conservado en museos durante dos décadas.
Los autores añaden: «Ahora es totalmente factible pensar en ensamblar genomas de cientos o incluso miles de especies, incluso dentro del presupuesto de investigación de un solo laboratorio. Este tipo de muestreo a gran escala a nivel de clado nos proporciona un nivel de resolución sin precedentes. estudiar las secuencias del genoma de grupos tan diversos como las moscas de la fruta y más, lo cual es un proceso evolutivo». seguramente mejorará nuestra comprensión de
Más información:
Kim BY, Gellert HR, Church SH, Suvorov A, Anderson SS, Barmina O, et al. (2024) Los conjuntos de genomas de una sola mosca llenan importantes vacíos filogenómicos en el árbol de la vida de Drosophila. Biología PLoS (2024) DOI: 10.1371/journal.pbio.3002697
Proporcionado por la Biblioteca Pública de Ciencias
referencia: Cientos de nuevas secuencias del genoma abren el árbol de la vida de la mosca de la fruta (2024, 18 de julio) Consultado el 19 de julio de 2024 en https://phys.org/news/2024-07-hundreds-genome-sequences-gaps-fruit. HTML
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